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血液が本来通る経路を通らずに近道をすること。爬虫類では、心室が完全に仕切られていないため、肺を通らずに全身へ戻る流れ（右左シャント）や、その逆（左右シャント）が起こりえます。
欠陥ではなく調節の手段で、酸素の需要が低いときは肺を経由する量を減らし、消化中のように需要が高いときは肺側へ多く送る、という使い方が報告されています。
ただし、どれだけ混ざるかの評価は資料によって割れています。ニシキヘビの心室は構造と弁の動きのために大きく可変なシャントはできない、とする研究もあります。当店のヘビの体の構造の記事にまとめています。